Högskolan i Skövde bedriver egen forskarutbildning inom Informationsteknologi. Antagningen till forskarutbildningen regleras i Högskolans antagningsordning (Dnr HS 2011/12-54, se http://www.his.se/hogskolan/styrdokument/forskning). Högskolans forskarutbildning inom informationsteknologi är fokuserad mot tre huvudsakliga inriktningar, nämligen datalogi, sociotekniska system och industriell informatik.
Utöver den egna forskarutbildningen har Högskolan utvecklat nära samarbete med andra universitet och högskolor inom andra forskarutbildningsämnen. Högskolans handledarkompetenta lärare är oavlönade docenter vid dessa lärosäten. Detta möjliggör att studenter kan antagas vid dessa samverkande lärosäten, men att utbildningen och handledningen genomförs vid Högskolan i Skövde, av Högskolans personal.
Högskolan har i dagsläget ca 70 forskarstuderande, varav ca 30 är inom det informationsteknologiska området.