Forskning i bioinformatik handlar om att utveckla och tillämpa algoritmer och programvara för att lösa problem i molekylärbiologi och biomedicin. Vår forskning sker i nära samarbete med biologier, för att försäkra att gruppens kompetens i datavetenskap blir användbar i relevanta tillämpningar.
Den systembiologiska ansatsen som präglar forskning i bioinformatik vilar på en stark datavetenskaplig grund och nära samarbete med andra forskningsgrupper i Forskningscentrum för systembiologi.
För närvarande drivs ett antal projekt inom olika tillämpningsområden. Exempel på projekt där vi har både nationellt och internationellt samarbete rör exempelvis:
- Bioinformatisk analys av genuttrycksdata i differentierade stamceller
Finansiär: KK-stiftelsen
Företagspartner: Cellartis AB
Akademiskt samarbete: Sahlgrenska universitetssjukhuset
- Bioinformatisk analys av köldadaption hos växter
Företagspartner: CropTailor AB
Akademiskt samarbete: Institutionen för cell- och molekylärbiologi vid Göteborgs universitet
- Identifiering av molekylära markörer för diagnos och prognos av cancer
Finansiär: Erik Philip-Sörensens stiftelse, Forskarskolan i medicinsk bioinformatik
- Akademiskt samarbete: Tumörbiologi, TATAA Biosciences, MultiD AB, Institutionen för Onkologi vid Göteborgs universitet, University of Nebraska, Örebro universitetssjukhus, Hälsoakademin vid Örebro universitet
- Utveckling av algoritmer för semantisk jämförelse av biologiska signalvägar
Akademiskt samarbete: Heriot-Watt University
- Utveckling av algoritmer för identifiering av moduler i proteinnätverk
Akademiskt samarbete: Heriot-Watt University
Forskningsgruppen består av följande medlemmar:
Docent
Björn Olsson
PhD
Zelmina Lubovac
Angelica Lindlöf
Doktorander
Jane Synnergren
Jonas Gamalielsson
Jessica Carlsson