Vid Högskolan i Skövde finns särskilda kvalitetsprocesser för att följa upp utbildning på grundnivå och avancerad nivå. År 2008 infördes ett system för utvärdering där huvudområden och utbildningsprogram skulle utvärderas kontinuerligt enligt en sexårig cykel. De lokala utvärderingarna var - såväl vad gällde innehåll som tidscykel - starkt kopplade till Högskoleverkets dåvarande utvärderingssystem.
Under 2008 och 2009 genomfördes utvärdering av utbildning inom datavetenskap, ingenjörsvetenskap och naturvetenskap (totalt 10 huvudområden och 16 utbildningsprogram). Forsknings- och utbildningsnämnden (FUN) ansvarade för utvärderingarna. Inom lärarutbildningens område utgick lärarutbildningsnämnden (LUN) från samma system och genomförde särskilda insatser inom sitt ansvarsområde.
Vid årsskiftet 2010/2011 infördes en ny nämndorganisation där två fakultetsnämnder (fakultetsnämnden för lärande, hälsa och samhälle samt fakultetsnämnden för teknik och natur) ersatte FUN och LUN. De nya nämnderna, som har ett övergripande ansvar för utbildningens kvalitet inom sina respektive områden, arbetar med att ta fram ett nytt lokalt system för utbildningsutvärdering. Utgångspunkten för det nya systemet är dels Högskoleverkets nya utvärderingssystem, dels den prövning av nya utvärderingsmetoder som genomfördes av FUN hösten 2010.