Institutionen är organiserad i två ämnesorienterade avdelningar: Avdelningen för naturvetenskap och avdelningen för vårdvetenskap. Varje avdelning består i sin tur av ett eller flera huvudområden/ kunskapsområden.
Ledningsgrupp
IVN:s ledningsgrupp består av prefekt, proprefekt och avdelningschefer.
Avdelningschefer
Varje avdelning leds av en avdelningschef som ansvarar för avdelningens verksamhet. I avdelningschefens uppdrag ingår bland annat akademiskt utvecklingsarbete, personal,ekonomi och arbetsmiljö.
Utbildningsråd
Den institutionsövergripande samordningen av och diskussionen om kvalitetsfrågor för utbildning på grundnivå och avancerad nivå bedrivs i grundutbildningsrådet. Rådet, som har möte en gång i månaden, består av ämnesföreträdare/företrädare för kunkapsområde/ämnesansvarig lärare och institutionens ledningsgrupp. Utbildningsrådet är ett rådgörande organ, men genom institutionsledningens medverkan kan prefektbeslut fattas under sittande möte.