Den pågående förlusten av biodiversitet gör att det finns ett stort behov av en bättre övervakning av terrestriska och akvatiska arter i deras naturliga habitat, särskilt av hotade, invasiva eller svårtillgängliga arter. I projektet kommer man genomföra studier för att utveckla nya metoder vars resultat ska integreras i löpande miljöövervaknings- och åtgärdsprogram.

Traditionella övervakningsmetoder, med akustisk eller optisk övervakning, är ineffektiva, dyra och tidskrävande. Med hjälp av så kallad miljö-DNA (DNA från naturliga processer som arter ger ifrån sig i miljön) kan man effektivare visa vilka arter som finns i habitaten, även för extremt sällsynta taxa. Miljö-DNA ger därför bra indikationer på var ytterligare traditionella mer ingående inventeringar i fält bör ske.

Identifiering av arter med rådande kunskapsbrist

Denna mer specifika fältdata kan sedan användas för habitat- och populationsmodellering av hotade arter. Inventeringarna tillsammans med modelleringar ger viktig information om biodiversitetens status till centrala och regionala myndigheter vilket är särskilt angeläget för hotade arter i kategorin ”kunskapsbrist”.

Nya metoder för att upptäcka hotade arter

Målen i denna studie är därför att sammanställa artobservationer från olika källor och generera en databas med utbredningsdata för svenska kräft- och blötdjurarter som har ”kunskapsbrist”. Därefter vill vi använda och utveckla nya genomiska metoder (DNA metabarcoding, ddPCR) för att spåra upp dessa hotade arter och utföra habitat- och populationsmodellering för att fastställa geografisk utbredning och populationernas status. Resultaten ska sedan integreras i löpande miljöövervaknings- och åtgärdsprogram.

Projektet i media:

• Forskarnas nya upptäckt i haven: ”Väldigt alarmerande” (Sveriges Radio)
• Forskare varnar för kris under vattenytan (Skövde nyheter)
• Vänerdagen fyller 25 år - Aktivitet under ForskarFredag (Skaraborgs nyheter)
• Nytt forskningsprojekt ska kartlägga sällsynta ryggradslösa djur (pressmeddelande)
• Spårning med eDNA visar en alarmerande situation under ytan (pressmeddelande)
• Oväntat fynd av små musslor i svenska sjöar

Publikationer

2023

A red listing gap analysis of molluscs and crustaceans in Northern Europe: What has happened in the last 10 years?

Sarah J. Bourlat, Georg F. Tschan, Sebastian Martin, Muhammad Iqram, Sonja Leidenberger

Biological Conservation

2023. Artikel. https://doi.org/10.1016/j.biocon.2023.110247

2021

An urban Blitz with a twist: rapid biodiversity assessment using aquatic environmental DNA

Kamil Hupało, Markus Majaneva, Molly Victoria Czachur, Lucas Sire, Daniel Marquina, Darío A. Lijtmaer, Vladislav Ivanov, Sonja Leidenberger, Fedor, Jr Čiampor, Zuzana Čiamporová-Zaťovičová, Izabela S. Mendes, Andrea Desiderato, Lasse Topstad, Kenny Meganck, Danial Hariz Z. A. et al.

Environmental DNA

2021. Artikel. https://doi.org/10.1002/edn3.152

Why are so many Northern European aquatic invertebrates missing in red-listing and how can we improve assessments for those?

Sonja Leidenberger, Iqram Muhammed, Sarah J. Bourlat

1st DNAQUA International Conference 2021

2021. Konferensbidrag, muntlig presentation med abstract.

2019

End biodiversity loss through improved tracking of marine threatened invertebrates

Sonja Leidenberger, Annie Jonsson, Sarah Bourlat

8th International Barcode of Life Conference 2019, June 17-20, 2019, Trondheim, Norway

2019. Konferensbidrag, poster.

Projektledare

Lektor i biovetenskap

Sonja Leidenberger

Institutionen för biovetenskap

E-postadress sonja.leidenberger@his.se

Telefonnummer 0500-448666