Gå till undermeny Gå till huvudinnehåll
Högskolan i Skövde, länk till startsida
Sök kurser och program Sök medarbetare

Sökträffar

    Sökträffar

    Visa alla resultat för ""
    Hittar inga resultat eller sökförslag för "."

    Söktips

    • Kontrollera att orden är rättstavade
    • Försök med andra sökord eller synonymer
    • Smalna av din sökning för att få fler träffar

    Genvägar

    Våra utbildningar

    Samarbeta med oss

    Jobba hos oss

    Hur kan vi hjälpa dig?

    Ny student

    Kontakta oss

    Hitta medarbetare

    International website
    Högskolan i Skövde, länk till startsida
    Högskolan i Skövde, länk till startsida
    Stäng
    Sök kurser och program Sök medarbetare

    Sökträffar

      Sökträffar

      Visa alla resultat för ""
      Hittar inga resultat eller sökförslag för "."

      Söktips

      • Kontrollera att orden är rättstavade
      • Försök med andra sökord eller synonymer
      • Smalna av din sökning för att få fler träffar

      Genvägar

      Våra utbildningar

      Samarbeta med oss

      Jobba hos oss

      Hur kan vi hjälpa dig?

      Ny student

      Kontakta oss

      Hitta medarbetare

      Högskolan i Skövde, länk till startsida

      Jane Synnergren

      Professor i bioinformatik
      Institutionen för biovetenskap
      Rum G2262
      e-post jane.synnergren@his.se
      Telefon 0500-448311

      Forskning

      2023

      Artificial intelligence supports automated characterization of differentiated human pluripotent stem cells

      Katarzyna Marzec-Schmidt, Nidal Ghosheh, Sören Richard Stahlschmidt, Barbara Küppers-Munther, Jane Synnergren, Benjamin Ulfenborg

      Stem Cells

      2023. Artikel. https://doi.org/10.1093/stmcls/sxad049 Open Access

      Lipid Nanoparticles Deliver the Therapeutic VEGFA mRNA In Vitro and In Vivo and Transform Extracellular Vesicles for Their Functional Extensions

      Muhammad Nawaz, Sepideh Heydarkhan-Hagvall, Benyapa Tangruksa, Hernán González-King Garibotti, Yujia Jing, Marco Maugeri, Franziska Kohl, Leif Hultin, Azadeh Reyahi, Alessandro Camponeschi, Bengt Kull, Jonas Christoffersson, Ola Grimsholm, Karin Jennbacken, Martina Sundqvist et al.

      Advanced Science

      2023. Artikel. https://doi.org/10.1002/advs.202206187 Open Access

      Regional transcriptomic profiling reveals immune system enrichment in nonfailing atria as well as all chambers of the failing human heart

      Mikael Sandstedt, Kristina Vukusic, Markus Johansson, Marianne Jonsson, Rasmus Magnusson, Lillemor Mattsson Hultén, Göran Dellgren, Anders Jeppsson, Anders Lindahl, Jane Synnergren, Joakim Sandstedt

      American Journal of Physiology. Heart and Circulatory Physiology

      2023. Artikel. https://doi.org/10.1152/ajpheart.00438.2023

      Expression of Stem Cell Niche-Related Biomarkers at the Base of the Human Tricuspid Valve

      Jacob Sjölin, Marianne Jonsson, Charlotta Orback, Anders Oldfors, Anders Jeppsson, Jane Synnergren, Victoria Rotter Sopasakis, Kristina Vukusic

      Stem Cells and Development

      2023. Artikel. https://doi.org/10.1089/scd.2022.0253 Open Access

      Predicting Cancer Stage from Circulating microRNA: A Comparative Analysis of Machine Learning Algorithms

      Sören Richard Stahlschmidt, Benjamin Ulfenborg, Jane Synnergren

      Bioinformatics and Biomedical Engineering: 10th International Work-Conference, IWBBIO 2023, Meloneras, Gran Canaria, Spain, July 12–14, 2023, Proceedings, Part I

      2023. Konferensbidrag. https://doi.org/10.1007/978-3-031-34953-9_8

      Personalized tissue-engineered veins – long term safety, functionality and cellular transcriptome analysis in large animals

      Klas Österberg, Yalda Bogestål, Lachmi Jenndahl, Tobias Gustafsson-Hedberg, Jane Synnergren, Gustav Holmgren, Eva Bom, Sarunas Petronis, Annika Krona, Jonna S. Eriksson, Jennifer Rosendahl, Veronica Crisostomo, Francisco M. Sanchez-Margallo, Claudia Baez-Diaz, Raimund Strehlc et al.

      Biomaterials Science

      2023. Artikel. https://doi.org/10.1039/d2bm02011d Open Access

      2022

      Data Mining Identifies CCN2 and THBS1 as Biomarker Candidates for Cardiac Hypertrophy

      Markus Johansson, Benyapa Tangruksa, Sepideh Heydarkhan-Hagvall, Anders Jeppsson, Peter Sartipy, Jane Synnergren

      Life

      2022. Artikel. https://doi.org/10.3390/life12050726 Open Access

      Multi-Omics Characterization of a Human Stem Cell-Based Model of Cardiac Hypertrophy

      Markus Johansson, Benjamin Ulfenborg, Christian X. Andersson, Sepideh Heydarkhan-Hagvall, Anders Jeppsson, Peter Sartipy, Jane Synnergren

      Life

      2022. Artikel. https://doi.org/10.3390/life12020293 Open Access

      Human intracardiac SSEA4+CD34 cells show features of cycling, immature cardiomyocytes and are distinct from Side Population and C-kit+CD45- cells

      Mikael Sandstedt, Kristina Vukusic, Benjamin Ulfenborg, Marianne Jonsson, Lillemor Mattsson Hultén, Göran Dellgren, Anders Jeppsson, Jane Synnergren, Joakim Sandstedt

      PLOS ONE

      2022. Artikel. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0269985 Open Access

      Multimodal deep learning for biomedical data fusion: a review

      Sören Richard Stahlschmidt, Benjamin Ulfenborg, Jane Synnergren

      Briefings in Bioinformatics

      2022. Artikel, forskningsöversikt. https://doi.org/10.1093/bib/bbab569 Open Access

      Pågående projekt

      Digitaliserat AI-verktyg för säkrare ATMPs

      Advanced Therapy Medicinal Products (ATMPs) är ett snabbt växande forskningsfält inom medicin med stor potential, där det finns ett växande behov av robusta och effektiva metoder för att karaktärisera och klassificera processer för bedömning av säkerhetsaspekter kring behandlingen. Projektet samlar intressenter från akademi och industri för utveckling av AI-baserade metoder för säkerhetsbedömning av ATMPs och för att identifiera nya säkerhetsbiomarkörer för att upptäcka avvikelser i tidiga skeden av ATMP-tillverkningsprocessen.

      November 2023 - Oktober 2026 Systembiologi

      ”Deep-learning” för ATMP tillverkning

      I projektet utvecklas och implementeras en innovative Deep-Learning (DL) metod för kvalitetsanalyser. För utveckling av metoden används humana embryonala stamceller som modellsystem för en stegvis utveckling av ett neuralt nätverk (NN) för klassificering av cellkvalitet med hjälp av kvantitativ PCR data (qPCR).

      Oktober 2022 - September 2024 Systembiologi

      BIO-AID - Biomedicinsk AI-driven dataanalys

      Artificiell intelligens (AI) är en viktig drivkraft som snabbt håller på att transformera sjukvård och läkemedelsindustrier på många sätt. Den stora mängden biomedicinsk data som idag finns tillgänglig erbjuder unika möjligheter att utveckla olika AI-baserade modeller. Det finns dock många utmaningar associerade med tillämpning av AI-metoder inom Life Science som ännu inte adresserats.

      Oktober 2020 - September 2024 Systembiologi

      Avslutade projekt

      Biomarkörer för toxicitetstestning

      Detta är ett av tre delprojekt inom synergiprojektet BioMine – Data-mining för identifiering, selektion och validering av biomarkörer. Delprojektet undersöker storskalig biomolekylär data för att identifiera specifika markörer som kan användas för att påvisa toxiska effekter på humana celler. Projektet är ett samarbete mellan Högskolan i Skövde, AstraZeneca Gothenburg och Takara Bio Europe.

      Oktober 2017 - Maj 2022 Systembiologi

      Data-mining för identifiering, selektion och validering av biomarkörer

      Inom BioMine-projektet studerar vi möjligheterna att använda storskalig biologisk data för att identifiera och validera biomarkörer inom Life-Science-området. Biomarkörer blir allt viktigare inom det biomedicinska området, och det finns ett växande behov av att identifiera nya markörer för diagnostik av sjukdomar och sjukdomsprogression.

      Oktober 2017 - Maj 2022 Systembiologi

      Biomarkörer för sjukdomsmodellering

      Detta är ett av tre delprojekt inom synergiprojektet BioMine - Data-mining för identifiering, selektion och validering av biomarkörer. Delprojektet undersöker storskalig biomolekylär data för att identifiera specifika markörer som kan användas för att studera olika sjukdomar.

      Oktober 2017 - Maj 2022 Systembiologi

      Vävnadsteknik för tillverkning av transplantat

      Vävnadsteknik för tillverkning av transplantat (TransTissuE) är ett samverkansprojekt mellan Högskolan i Skövde, VERIGRAFT och XVIVO. Tillsammans vill vi utveckla metoder och strategier för att optimera tillverkningen av individanpassade kärltransplantat.

      April 2019 - September 2021 Systembiologi

      CardioTrophy - för minskad sjuklighet och dödlighet i kardiovaskulära sjukdomar

      Den framgångsrika utvecklingen av stamcellsforskningen de senaste åren har möjliggjort att det nu går att framställa stora mängder av mänskliga celler för användning inom olika in vitro tillämpningar. Detta förväntas ha särskilt stor betydelse för läkemedelsutvecklingen eftersom man nu kan testa många olika substanser parallellt i laborativa experiment. CardioTrophys målsättning är att, genom att generera ny kunskap, bidra till få fram nya behandlingar och terapier för att minska sjuklighet och dödlighet i kardiovaskulära sjukdomar.

      Mars 2017 - Februari 2021 Systembiologi

      AlgorOmics - vi utvecklar nya algoritmer för biomarkörsidentifiering

      Inom AlgorOmics vill vi utveckla och implementera algoritmer för integration, visualisering och analys av storskaliga omics-data, med tillämpningar i stamcellsdifferentiering och läkemedelsutveckling.

      April 2017 - Mars 2020 Systembiologi

      Biomedical Big Data

      Detta projekt är ett delprojekt i ett större synergiprojekt (BISON) med fokus på dataanalys av Big data. Projektet syftar till att utveckla bioinformatiska metoder och algoritmer för analys och integrering av storskalig biomedicinsk data. De senaste åren har en massiv digitalisering av data och information genomförts i samhället och majoriteten av all världens information uppskattas numera vara digital.

      Oktober 2015 - September 2019 Systembiologi

      Human stamcellsbaserad in vitro modell av blod-hjärnbarriären

      Läkemedelsindustrin har ett omedelbart behov av in vitro-modeller med hög human relevans som kan användas för att modellera viktiga funktioner i olika organ. Projektet vill utveckla en human in vitro-modell baserad på humana pluripotenta stamceller som kan modellera viktiga aspekter av blod-hjärnbarriären.

      Oktober 2015 - September 2018 Systembiologi

      Avvikande metyleringsmönster i stamcellsderiverade hepatocyter

      Humana pluripotenta stamceller (hPSCs) har unika egenskaper såsom proliferation och förmåga att differentiera till funktionella celltyper. Dessa egenskaper gör hPSCs till en lovande källa av humana celler som kan användas för grundforskning, läkemedelsutveckling och regenerativ medicin.

      Juli 2013 - Juni 2016 Systembiologi
      Publicerad: 2020-01-09
      Senast ändrad: 2020-01-09
      Sidansvarig: webmaster@his.se