Sökträffar

    Sökträffar

    Visa alla resultat för ""
    Hittar inga resultat eller sökförslag för "."

    Söktips

    • Kontrollera att orden är rättstavade
    • Försök med andra sökord eller synonymer
    • Smalna av din sökning för att få fler träffar

    Hur kan vi hjälpa dig?

    Ny student

    Kontakta oss

    Hitta medarbetare

    Gå till undermeny Gå till huvudinnehåll
    Högskolan i Skövde, länk till startsida
    Högskolan i Skövde, länk till startsida

    Sökträffar

      Sökträffar

      Visa alla resultat för ""
      Hittar inga resultat eller sökförslag för "."

      Söktips

      • Kontrollera att orden är rättstavade
      • Försök med andra sökord eller synonymer
      • Smalna av din sökning för att få fler träffar

      Hur kan vi hjälpa dig?

      Ny student

      Kontakta oss

      Hitta medarbetare

      Data-mining för identifiering, selektion och validering av biomarkörer

      Translationell Bioinformatik
      Systembiologi

      Kort om projektet

      Projektnamn

      Data-mining för identifiering, selektion och validering av biomarkörer

      Projekttid

      2017-10-01 - 2021-09-03

      Finansiering

      KK-Stiftelsen.

      Partners

      AstraZeneca, Takara Bio Europe AB, Unilabs AB, 1928 Diagnostics AB, TATAA Biocenter AB, Olink Proteomics AB.

      Inom BioMine projektet så studerar vi möjligheterna att använda storskalig biologisk data för att identifiera och validera biomarkörer inom Life-Science området.

      Biomarkörer blir allt viktigare inom det biomedicinska området, och det finns ett växande behov av att identifiera nya markörer för diagnostik av sjukdomar och sjukdomsprogression. Biomarkörer kan också bidra till att möjliggöra individanpassad behandling och upptäcka tidiga terapeutiska och negativa reaktioner av läkemedel. Vidare är biomarkörer för olika cellulära processer viktiga inom cellbiologin och kan exempelvis vara användbara för att fastställa cellidentitet. De kan också användas för isolering av specifika cellpopulationer såväl som för övervakning av fysiologiska eller patofysiologiska processer in vitro.

      Går att parallellt mäta tusentals markörer

      Det finns ett stort intresse och höga förväntningar på att kunna använda storskalig "omics"-data för att identifiera biomarkörer, främst data inom områdena transcriptomics, proteomics, metabolomics och genomics. Men många utmaningar och svårigheter återstår fortfarande att lösa, i synnerhet när det gäller utveckling av algoritmer för storskalig dataanalys vid olika kombinationer av datamängder. Den tekniska utvecklingen har gått mycket snabbt och möjligheten finns nu att parallellt mäta tusentals markörer, och tekniken utvecklats i en snabbare takt än analysmetoderna för tolkningen av dessa stora mängder biologisk data.

      Delprojekt med fokus på toxicitetstestning, sjukdomsmodellering och klinisk diagnostisering

      Inom BioMine projektet så studerar vi möjligheterna att använda storskalig biologisk data för att identifiera och validera biomarkörer inom Life-Science området. Vi bedriver studier inom tre specifika delområden med fokus på att generera och analysera storskalig data. De tre delprojekten inkluderar toxicitetstestning, sjukdomsmodellering och klinisk diagnostisering. Stor vikt läggs i projektet vid att utveckla metoder för kombinerade analyser av olika typer av molekylär data.

      Projektet genomförs i samarbete mellan Högskolan i Skövde och våra industripartners (AstraZeneca Gothenburg, Takara Bio Europe AB, Unilabs AB, 1928 Diagnostics AB, TATAA Biocenter AB och Olink Proteomics AB).

      Belyser både industriella och akademiska aspekter

      Projektet förväntas generera nya prediktiva multimarkörpaneler samt innovativa algoritmer och analysprocesser för identifiering av biomarkörer från en kombination av datakällor och datatyper. Projektet belyser både industriella och akademiska aspekter av biomarkörforskning och innehåller aktiviteter som adresserar dels stora utmaningar och behov inom industrin men också rent akademiskt vetenskapliga frågeställningar. Gemensamma frågor formuleras av forskarteamet vid Högskolan i Skövde, vilket säkerställer att senaste tekniker och ansatser inom metodutveckling tillämpas och sprids vidare inom och utanför projektet.

      Kontakt

      Bitr. professor bioinformatik

      Medverkande forskare

      Publicerad: 2020-01-10
      Senast ändrad: 2020-01-10
      Sidansvarig: webmaster@his.se