Benjamin Ulfenborg

Utbildning
Forskning
Under min doktorandtid utvecklade jag nya bioinformatiska algoritmer och verktyg för att hitta biomarkörer för livmodercancer. Forskningen bedrevs i ett samarbete mellan Högskolan i Skövde och Örebro Universitet. Jag disputerade 2016 och påbörjade en post doc i forskargruppen TransBiG, där jag arbetade med algoritmutveckling och storskaliga dataanalyser för att öka mekanisk förståelse för stamcellsdifferentiering och stamcellsbaserade in vitro-modeller. Jag blev biträdande lektor i bioinformatik 2018 och har sedan dess varit involverade i flera forskningsprojekt inom och utanför Högskolan.
Min forskning syftar till att utveckla kraftfulla bioinformatiska algoritmer och verktyg för at hitta biomarkörer och öka förståelsen för reglering av biologiska processer. Jag har ett särskilt stort intresse för integrering av olika typer av data och för maskininlärning. Exempel på verktyg jag publicerat är R-paketen Miodin för integrering av multi-omics data och MAsC för klustring av storskaliga data.
2022
Scientific Reports
2022. Artikel.
https://doi.org/10.1038/s41598-022-15924-x
International Journal of Cancer
2022. Artikel.
https://doi.org/10.1002/ijc.34111
Life
2022. Artikel.
https://doi.org/10.3390/life12020293
PLOS ONE
2022. Artikel.
https://doi.org/10.1371/journal.pone.0269985
Briefings in Bioinformatics
2022. Artikel, forskningsöversikt.
https://doi.org/10.1093/bib/bbab569
2021
Frontiers in Cardiovascular Medicine
2021. Artikel.
https://doi.org/10.3389/fcvm.2021.753470
Clinical Chemistry and Laboratory Medicine
2021. Artikel.
https://doi.org/10.1515/cclm-2021-0510
Journal of Biotechnology
2021. Artikel.
https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2020.12.002
2020
International Journal of Molecular Sciences
2020. Artikel.
https://doi.org/10.3390/ijms21020469
Biology open
2020. Artikel.
https://doi.org/10.1242/bio.052381