Sökträffar

    Sökträffar

    Visa alla resultat för ""
    Hittar inga resultat eller sökförslag för "."

    Söktips

    • Kontrollera att orden är rättstavade
    • Försök med andra sökord eller synonymer
    • Smalna av din sökning för att få fler träffar

    Hur kan vi hjälpa dig?

    Ny student

    Kontakta oss

    Hitta medarbetare

    Högskolan i Skövde, länk till startsida

    Sökträffar

      Sökträffar

      Visa alla resultat för ""
      Hittar inga resultat eller sökförslag för "."

      Söktips

      • Kontrollera att orden är rättstavade
      • Försök med andra sökord eller synonymer
      • Smalna av din sökning för att få fler träffar

      Hur kan vi hjälpa dig?

      Ny student

      Kontakta oss

      Hitta medarbetare

      Högskolan i Skövde, länk till startsida

      Benjamin Ulfenborg

      Lektor i bioinformatik
      Institutionen för biovetenskap
      Rum G2246
      Benjamin Ulfenborg, lektor i bioinformatik. Undervisar på grund, avancerad och forskarnivå främst inom bioinformatik. Deltar i flera forskningsprojekt som bedrivs av forskargruppen TransBiG på Högskolan och i externa samarbeten.

      Utbildning

      Programansvarig

      Program
      60 hp
      Avancerad nivå
      Program
      120 hp
      Avancerad nivå

      Forskning

      Min forskning

      Under min doktorandtid utvecklade jag nya bioinformatiska algoritmer och verktyg för att hitta biomarkörer för livmodercancer. Forskningen bedrevs i ett samarbete mellan Högskolan i Skövde och Örebro Universitet. Jag disputerade 2016 och påbörjade en post doc i forskargruppen TransBiG, där jag arbetade med algoritmutveckling och storskaliga dataanalyser för att öka mekanisk förståelse för stamcellsdifferentiering och stamcellsbaserade in vitro-modeller. Jag blev biträdande lektor i bioinformatik 2018 och har sedan dess varit involverade i flera forskningsprojekt inom och utanför Högskolan.

      Min forskning syftar till att utveckla kraftfulla bioinformatiska algoritmer och verktyg för at hitta biomarkörer och öka förståelsen för reglering av biologiska processer. Jag har ett särskilt stort intresse för integrering av olika typer av data och för maskininlärning. Exempel på verktyg jag publicerat är R-paketen Miodin för integrering av multi-omics data och MAsC för klustring av storskaliga data.

      2022

      Maria Araceli Diaz Cruz, Benjamin Ulfenborg, Peter Blomstrand, Maria Faresjö, Fredrik Ståhl, Sandra Karlsson

      Scientific Reports

      2022. Artikel. https://doi.org/10.1038/s41598-022-15924-x Open Access

      Shruti Jain, Nimrah Nadeem, Benjamin Ulfenborg, Maria Mäkelä, Shamima Afrin Ruma, Joonas Terävä, Kaisa Huhtinen, Janne Leivo, Björg Kristjansdottir, Kim Pettersson, Karin Sundfeldt, Kamlesh Gidwani

      International Journal of Cancer

      2022. Artikel. https://doi.org/10.1002/ijc.34111 Open Access

      Markus Johansson, Benjamin Ulfenborg, Christian X. Andersson, Sepideh Heydarkhan-Hagvall, Anders Jeppsson, Peter Sartipy, Jane Synnergren

      Mikael Sandstedt, Kristina Vukusic, Benjamin Ulfenborg, Marianne Jonsson, Lillemor Mattsson Hultén, Göran Dellgren, Anders Jeppsson, Jane Synnergren, Joakim Sandstedt

      Sören Richard Stahlschmidt, Benjamin Ulfenborg, Jane Synnergren

      Briefings in Bioinformatics

      2022. Artikel, forskningsöversikt. https://doi.org/10.1093/bib/bbab569 Open Access

      2021

      Cláudia Correia, Qing-Dong Wang, Gunilla Linhardt, Leif G. Carlsson, Benjamin Ulfenborg, Anna Walentinsson, Katarina Rydén-Markinhutha, Margareta Behrendt, Johannes Wikström, Peter Sartipy, Karin Jennbacken, Jane Synnergren

      Frontiers in Cardiovascular Medicine

      2021. Artikel. https://doi.org/10.3389/fcvm.2021.753470 Open Access

      Maria Lycke, Benjamin Ulfenborg, Jacob Malchau Lauesgaard, Björg Kristjansdottir, Karin Sundfeldt

      Clinical Chemistry and Laboratory Medicine

      2021. Artikel. https://doi.org/10.1515/cclm-2021-0510 Open Access

      Benjamin Ulfenborg, Alexander Karlsson, Maria Riveiro, Christian X. Andersson, Peter Sartipy, Jane Synnergren

      Journal of Biotechnology

      2021. Artikel. https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2020.12.002 Open Access

      2020

      Gustav Holmgren, Benjamin Ulfenborg, Annika Asplund, Karin Toet, Christian X. Andersson, Ann Hammarstedt, Roeland Hanemaaijer, Barbara Küppers-Munther, Jane Synnergren

      International Journal of Molecular Sciences

      2020. Artikel. https://doi.org/10.3390/ijms21020469 Open Access

      Markus Johansson, Benjamin Ulfenborg, Christian X. Andersson, Sepideh Heydarkhan-Hagvall, Anders Jeppsson, Peter Sartipy, Jane Synnergren

      Biology open

      2020. Artikel. https://doi.org/10.1242/bio.052381 Open Access

      AlgorOmics - vi utvecklar nya algoritmer för biomarkörsidentifiering

      April 2017 - Mars 2020 Systembiologi

      Vävnadsteknik för tillverkning av transplantat

      April 2019 - September 2021 Systembiologi

      Human stamcellsbaserad in vitro modell av blod-hjärnbarriären

      Oktober 2015 - September 2018 Systembiologi

      Biomedical Big Data

      Oktober 2015 - September 2019 Systembiologi

      Biomarkörer för sjukdomsmodellering

      Oktober 2017 - Maj 2022 Systembiologi

      Biomarkörer för toxicitetstestning

      Oktober 2017 - Maj 2022 Systembiologi

      BIO-AID - Biomedicinsk AI-driven dataanalys

      Oktober 2020 - September 2024 Systembiologi

      Data-mining för identifiering, selektion och validering av biomarkörer

      Oktober 2017 - Maj 2022 Systembiologi
      Publicerad: 2020-01-09
      Senast ändrad: 2020-01-09
      Sidansvarig: webmaster@his.se