Benjamin Ulfenborg
Lektor i bioinformatik
Institutionen för biovetenskap
Metoder och verktyg för programutveckling inom bioinformatik G2F
Kurs, Grundnivå,
7,5 hp,
BI503G
Anmälan
Välj ett tillfälle för att visa kursplan och behörighetskrav.
Hittar inga aktuella utbildningstillfällen. Kontakta kursansvarig eller studievägledare om du har frågor.
Utveckling av avancerad programvara för analys av biologiska data ställer programmeraren inför flera utmaningar. I den här kursen lär du dig använda centrala verktyg för att utveckla robusta och portabla programvaror inom bioinformatiken.
Den här kursen går igenom ett antal verktyg och metoder för utveckling av avancerade mjukvaror inom bioinformatiken. Huvudmomenten i kursen handlar om hur man arbetar med versionshantering av källkod, hur man paketerar mjukvara i diskreta miljöer, hur man på ett strukturerat sätt utvecklar mjukvara i ett team, samt hur man kombinerar olika mjukvaror till analysflöden. Föreläsningar och datorövningar kombineras för att gå igenom teorin och omsätta denna i praktik. Kursen förutsätter kunskaper om Unix och programmeringsvana i Python och R.
